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Omics analysis of red seabream (Pagrus major) fed a soybean meal-based diet
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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fra_k_53_37.pdf (1004.6 KB)
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.png)
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| アイテムタイプ | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2026-04-01 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Omics analysis of red seabream (Pagrus major) fed a soybean meal-based diet | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Pagrus major; transcriptome; metabolome; soybean meal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | 10.57348/0002016032 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
吉永, 葉月
× 吉永, 葉月
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1005
× 安池, 元重
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871
× 馬久地, みゆき
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811
× 相馬, 智史
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919
× 山本, 剛史
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661
× 村下, 幸司
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293
× 松成, 宏之
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313
× 奥, 宏海
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384
× 古板, 博文
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615
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | In response to the increasing demand for seafood, aquaculture production has been expanding worldwide in recent years. On the other hand, the high demand and unstable supply of fishmeal (FM) has made feed manufacturers difficult to use FM as the main ingredient in aquaculture feeds. Soybean meal (SBM) is one of the most promising substitutes for FM in aquaculture feeds because of its economic advantages and nutritional properties. Although SBM has a relatively high protein content and balanced amino acid composition, it has been reported that feeding of a large amount of SBM has adverse effects on the physiology and growth of fish. To facilitate the development of more effective aquaculture feeds containing SBM, it is required to elucidate the effects of dietary SBM on fish nutritional metabolism in detail. In this study, comprehensive approaches, i.e., transcriptomics and metabolomics analyses, were employed to investigate the effects of SBM on nutritional metabolism in red seabream (Pagrus major). Red seabream fingerlings were fed an SBM-based diet (SBMD) and FM-based control diet (FMD) for eight weeks and the hepatopancreas collected at 2, 4, and 8 weeks were used for transcriptome analysis. Growth retardation, and several abnormal physiological conditions such as lower serum cholesterol content and tissue degeneration in the distal intestine, were observed in the SBMD group. Transcriptome analysis (RNA-Seq) identified differentially expressed genes between the SBMD and FMD groups and showed increases in the expression levels of genes involved in the terpenoid and steroid biosynthesis pathways in the former group, suggesting that hepatic cholesterol biosynthesis was up-regulated in the SBMD group. The hepatopancreas of fish fed each diet for 8 weeks was also subjected to metabolome analysis and the results, coupled with the transcriptome analysis, suggest that SBMD affects the glutathione and glycine metabolism. Additionally, transcriptome of the distal intestine at 8 weeks revealed the changes in the expression levels of genes related to the cell cycle control and cholesterol metabolism. This study provides valuable information that enhances the understanding of the effects of dietary SBM on red seabream metabolism, which will lead to the development of a novel technology that relieves the abnormal physiological conditions. Findings obtained from omics analysis could be used to identify the indices of negative effects caused by respective alternative ingredients and thereby lead to the improvement of the quality of future aquaculture feeds. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
ja : 水産研究・教育機構研究報告 en : Bulletin of Japan Fisheries Research and Education Agency 巻 53, p. 37-44, ページ数 8, 発行日 2026-03-25 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | 水産研究・教育機構 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Japan Fisheries Research and Education Agency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 2758-3953 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12767505 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 情報源 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | Local | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | fra_k_53_37 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
