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アイテム
マグロ属(Thunnus)種内および種間におけるmtDNA制限酵素切断型多型
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2002208
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2002208e199faf0-eecb-4687-8be7-973bf2fad030
| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||||||
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| 公開日 | 2024-04-22 | |||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||
| タイトル | マグロ属(Thunnus)種内および種間におけるmtDNA制限酵素切断型多型 | |||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||
| タイトル | Intra-and interspecific restriction fragment length polymorphism in mitochondrial genes of Thunnus tuna species | |||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||
| アクセス権 | metadata only access | |||||||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_14cb | |||||||||||||||||
| 著者 |
張, 成年
× 張, 成年
× 井上, 信吾
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| 抄録 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||
| 内容記述 | Three DNA fragments of mitochondrial cytochrome b (cytb) and 12S rRNA (12Sr) genes and flanking region (ATCO) between ATPase6 and cytochrome oxidase subunit III genes of eight Thunnus tuna species were amplified by polymerase chain reaction (PCR). Restriction fragment length polymorphisms (RFLP) within and between species were investigated on these amplified fragments. No RFLP between species was observed in 12Sr fragment for twenty endonuclease digestions. RFLPs observed in cytb fragment separated tuna species into four groups. Atlantic northern bluefin (T. thynnus thynnus) and yellowfin (T. albacares) each could be descriminated from the other species. One individual out of thirtytwo Pacific northern bluefin (T. t. orientalis) examined had identical restriction patterns with those of the Atlantic counterpart, while the other individuals of the Pacific one were identical with albacore (T. alalunga). The other four species (T. atlanticus, T. maccoyii, T. obesus and T. tonggol) were found to share identical restriction profiles one another. For ATCO fragment, RFLPs within or between species were observed in eleven endonuclease digestions out of twenty used. Sufficient interspecific polymorphisms for separating all eight species were detected by minimum of three endonuclease digestions (Alu I, Mse I and Hinc II or Hinf I), except for one individual of the Pacific northern bluefin which was identical with the Atlantic one. Percent of shared fragments between species indicated that the Pacific northern bluefin was closer to albacore than to its Atlantic counterpart and southern bluefin which were close to yellowfin. Relatively high intraspecific polymorphisms were observed in two species (T. albacares and T. alalunga). These results indicated reliable use of this PCR-RFLP analysis for species identification and genetic stock structure study. | |||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||
| 内容記述 | マグロ類mtDNA 分子内の3種類の遺伝子領域(cytochrome b,12S rRNA,ATPase)からPCR法によって3種類のDNA断片(cytb,12Sr,ATCO)を増幅し、各断片について制限酵素処理を行なった。マグロ属の8種間および種内での切断型多型を検索し種判別、系群構造の遺伝学的分析に対する本法の有効性について検討した。増幅した断片の長さはそれぞれ355,450,940塩基対であり種間における長さの差は見られなかった。12Sr断片では、20種類の制限酵素による切断型に魚種間で差が見られなかった。cytb 断片では、大西洋クロマグロ(T.thynnus thynnus)とキハダ(T.albacares)においてそれぞれ特異的切断型が見られ他種から分けられた。太平洋クロマグロ(T. t. orientalis)32個体中1個体が大西洋クロマグロと同一の切断型を示し、他個体はビンナガ(T. alalunga)と同一であった。タイセイヨウマグロ(T.atlanticus)、ミナミマグロ(T.maccoyii)、メバチ(T.obesus)、コシナガ(T.tonggol)4種間の切断型に差は見られなかった。ATCO断片では使用した20種類の制限酵素のうち11種で種間および種内個体間での切断型多型が見られた。上記の太平洋クロマグロ1個体はこの断片においても大西洋クロマグロと同一の切断型を示した。この1個体を除けば、3種類の制限酵素(Alul,MseI,HincIIまたは HinfI)による切断型を用いて全種の判別が可能であった。切断型を比較した場合、太平洋のクロマグロは大西洋型のものよりむしろヒンナガに似ていること、ミナミマグロはクロマグロよりもキハダに似ていることが示され、従来の系統関係を再検討する必要があるものと考えられた。ビンナガ、キハダではそれぞれ4種類の切断型が見られ、短いDNA断片でも比較的高いレベルの種内切断型多型の検出が可能であることが示唆された。本法はアルコール保存された微小な卵稚仔標本も分析の対象とすることができるため、特に高度回遊性魚種における系群構造の遺伝学的分析に有効であるものと考えられる。 | |||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||
| 書誌情報 |
ja : 遠洋水産研究所研究報告 en : Bulletin of National Research Institute of Far Seas Fisheries 巻 30, p. 207-225, ページ数 19, 発行日 1993-03 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||
| 出版者 | 遠洋水産研究所 | |||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||
| 出版者 | The National Research Institute of Far Seas Fisheries | |||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0386-7285 | |||||||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AN00025949 | |||||||||||||||||
| 情報源 | ||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | Local | |||||||||||||||||
| 関連識別子 | enyo_k_30-207 | |||||||||||||||||
| 関連サイト | ||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010500359 | |||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||
| 関連名称 | 日本農学文献記事索引 （AgriKnowledge） | |||||||||||||||||
