WEKO3
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Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2010388
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/20103885c8ec148-a060-4ee4-bf50-5a0fcfbfa86f
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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Ando et al. Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus.pdf (923 KB)
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2024-07-23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
アンドウ, マサヒロ
× アンドウ, マサヒロ
× スギヤマ, カオリ
× クボ, コウヤ
× ホリイ, シュンペイ
× 羽野, 健志
WEKO
946
× 外丸, 裕司
WEKO
737
× タケヤマ, ハルコ
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Harmful algal blooms (HABs) are a natural phenomenon caused by outbreaks of algae, resulting in serious problems for aquatic ecosystems and the coastal environment. Chaetoceros tenuissimus (C. tenuissimus) is one of the diatoms responsible for HABs. The growth curve of C. tenuissimus can be observed from beginning to end of HABs: therefore, detailed analysis is necessary to characterize each growth phase of C. tenuissimus. It is important to examine the phenotype of each diatom cell individually, as they display heterogeneity even in the same growth phase. Raman spectroscopy is a label-free technique to elucidate biomolecular profiles and spatial information at the cellular level. Multivariate data analysis (MVA) is an efficient method for the analysis of complicated Raman spectra, to identify molecular features. Here, we utilized Raman microspectroscopy to identify the molecular information of each diatom cell, at the single-cell level. The MVA, together with a support vector machine, which is a machine learning technique, allowed the classification of proliferating and nonproliferating cells. The classification includes polyunsaturated fatty acids such as linoleic acid, eicosapentaenoic acid, and docosahexaenoic acid. This study indicated that Raman spectroscopy is an appropriate technique to examine C. tenuissimus at the single-cell level, providing relevant data to assess the correlation between the molecular details obtained from the Raman analysis, at each growth phase. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Journal of Physical Chemistry B (Soft Condensed Matter and Biophysical Chemistry) 巻 127, 号 22, p. 5027-5033, ページ数 7, 発行日 2023-05-27 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | American Chemical Society | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | アメリカ化学会 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1520-6106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1520-5207 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.1021/acs.jpcb.3c02152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 情報源 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | Local | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 23343105 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | 水産技術研究所 環境・応用部門 環境保全部 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連サイト | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.3c02152 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | ACS Publications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
