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  1. 学術雑誌論文

Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus

https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2010388
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2010388
5c8ec148-a060-4ee4-bf50-5a0fcfbfa86f
名前 / ファイル ライセンス アクション
Ando Ando et al. Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus.pdf (923 KB)
Item type 学術雑誌論文 / Journal Article(1)
公開日 2024-07-23
タイトル
タイトル Single-Cell Level Raman Molecular Profiling Reveals the Classification of Growth Phases of Chaetoceros tenuissimus
言語 en
言語
言語 eng
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
資源タイプ journal article
著者 アンドウ, マサヒロ

× アンドウ, マサヒロ

en Ando, Masahiro
Waseda University

ja アンドウ, マサヒロ
早稲田大学

ja-Kana アンドウ, マサヒロ

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スギヤマ, カオリ

× スギヤマ, カオリ

en Sugiyama, Kaori
Waseda University

ja スギヤマ, カオリ
早稲田大学

ja-Kana スギヤマ, カオリ

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クボ, コウヤ

× クボ, コウヤ

en Kubo, Koya
Waseda University

ja クボ, コウヤ
早稲田大学

ja-Kana クボ, コウヤ

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ホリイ, シュンペイ

× ホリイ, シュンペイ

en Horii, Shumpei
Waseda University

ja ホリイ, シュンペイ
早稲田大学

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羽野, 健志

× 羽野, 健志

WEKO 946
e-Rad 30621057
ORCID 0000-0002-7670-5264

en Hano, Takeshi

ja 羽野, 健志


ja-Kana ハノ, タケシ

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外丸, 裕司

× 外丸, 裕司

WEKO 737
e-Rad 10416042

en Tomaru, Yuji

ja 外丸, 裕司


ja-Kana トマル, ユウジ

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タケヤマ, ハルコ

× タケヤマ, ハルコ

en Takeyama, Haruko
Waseda University

ja タケヤマ, ハルコ
早稲田大学

ja-Kana タケヤマ, ハルコ

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抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Harmful algal blooms (HABs) are a natural phenomenon caused by outbreaks of algae, resulting in serious problems for aquatic ecosystems and the coastal environment. Chaetoceros tenuissimus (C. tenuissimus) is one of the diatoms responsible for HABs. The growth curve of C. tenuissimus can be observed from beginning to end of HABs: therefore, detailed analysis is necessary to characterize each growth phase of C. tenuissimus. It is important to examine the phenotype of each diatom cell individually, as they display heterogeneity even in the same growth phase. Raman spectroscopy is a label-free technique to elucidate biomolecular profiles and spatial information at the cellular level. Multivariate data analysis (MVA) is an efficient method for the analysis of complicated Raman spectra, to identify molecular features. Here, we utilized Raman microspectroscopy to identify the molecular information of each diatom cell, at the single-cell level. The MVA, together with a support vector machine, which is a machine learning technique, allowed the classification of proliferating and nonproliferating cells. The classification includes polyunsaturated fatty acids such as linoleic acid, eicosapentaenoic acid, and docosahexaenoic acid. This study indicated that Raman spectroscopy is an appropriate technique to examine C. tenuissimus at the single-cell level, providing relevant data to assess the correlation between the molecular details obtained from the Raman analysis, at each growth phase.
言語 en
書誌情報 en : Journal of Physical Chemistry B (Soft Condensed Matter and Biophysical Chemistry)

巻 127, 号 22, p. 5027-5033, ページ数 7, 発行日 2023-05-27
出版者
出版者 American Chemical Society
言語 en
出版者
出版者 アメリカ化学会
言語 ja
ISSN
収録物識別子タイプ PISSN
収録物識別子 1520-6106
書誌レコードID
収録物識別子タイプ EISSN
収録物識別子 1520-5207
DOI
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ DOI
関連識別子 10.1021/acs.jpcb.3c02152
情報源
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ Local
関連識別子 23343105
言語 ja
関連名称 水産技術研究所 環境・応用部門 環境保全部
関連サイト
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ URI
関連識別子 https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.3c02152
言語 en
関連名称 ACS Publications
著者版フラグ
出版タイプ VoR
出版タイプResource http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
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Ver.1 2024-07-23 04:33:47.052480
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