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  1. 学術雑誌論文

Comparative evaluation of analytical pipelines for illumina short- and nanopore long-read 16S rRNA gene amplicon sequencing with mock microbial communities

https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2002143
https://fra.repo.nii.ac.jp/records/2002143
184430db-f1a5-4be9-ad9a-bcecc8ea9ba8
名前 / ファイル ライセンス アクション
Ota Ota et al Comparative evaluation of analytical pipelines.pdf (612 KB)
Item type 学術雑誌論文 / Journal Article(1)
公開日 2024-04-15
タイトル
タイトル Comparative evaluation of analytical pipelines for illumina short- and nanopore long-read 16S rRNA gene amplicon sequencing with mock microbial communities
言語 en
言語
言語 eng
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
資源タイプ journal article
著者 オオタ, ユウスケ

× オオタ, ユウスケ

en Ota, Yusuke
Tokyo Medical and Dental University

ja オオタ, ユウスケ
東京医科歯科大学

ja-Kana オオタ, ユウスケ
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ヤスナガ, ケイ

× ヤスナガ, ケイ

en Yasunaga, Kei
Tokyo Medical and Dental University

ja ヤスナガ, ケイ
東京医科歯科大学

ja-Kana ヤスナガ, ケイ
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Mahazu, Samiratu

× Mahazu, Samiratu

en Mahazu, Samiratu
Tokyo Medical and Dental University

ja 東京医科歯科大学

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Prah, Isaac

× Prah, Isaac

en Prah, Isaac
Tokyo Medical and Dental University

ja 東京医科歯科大学

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長井, 敏

× 長井, 敏

WEKO 567
e-Rad 80371962

en Nagai, Satoshi
ja 長井, 敏
ja-Kana ナガイ, サトシ
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ハヤシ, タカヤ

× ハヤシ, タカヤ

en Hayashi, Takaya
Tokyo Medical and Dental University

ja ハヤシ, タカヤ
東京医科歯科大学

ja-Kana ハヤシ, タカヤ
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スズキ, マサト

× スズキ, マサト

en Suzuki, Masato
National Institute of Infectious Diseases

ja スズキ, マサト
国立感染症研究所

ja-Kana スズキ, マサト
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ヨシダ, ミツノリ

× ヨシダ, ミツノリ

en Yoshida, Mitsunori
National Institute of Infectious Diseases

ja ヨシダ, ミツノリ
国立感染症研究所

ja-Kana ヨシダ, ミツノリ
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ホシノ, ヨシヒコ

× ホシノ, ヨシヒコ

en Hoshino, Yoshihiko
National Institute of Infectious Diseases

ja ホシノ, ヨシヒコ
国立感染症研究所

ja-Kana ホシノ, ヨシヒコ
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アケダ, ユキヒロ

× アケダ, ユキヒロ

en Akeda, Yukihiro
National Institute of Infectious Diseases

ja アケダ, ユキヒロ
国立感染症研究所

ja-Kana アケダ, ユキヒロ
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スズキ, トシヒコ

× スズキ, トシヒコ

en Suzuki, Toshihiko
Tokyo Medical and Dental University

ja スズキ, トシヒコ
東京医科歯科大学

ja-Kana スズキ, トシヒコ
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グ, ヨシアキ

× グ, ヨシアキ

en Gu, Yoshiaki
Tokyo Medical and Dental University

ja グ, ヨシアキ
東京医科歯科大学

ja-Kana グ, ヨシアキ
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サイトウ, リョウイチ

× サイトウ, リョウイチ

en Saito, Ryoichi
Tokyo Medical and Dental University

ja サイトウ, リョウイチ
東京医科歯科大学

ja-Kana サイトウ, リョウイチ
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内容記述
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Utility of a recently developed long-read pipeline, Emu, was assessed using an expectation-maximization algorithm for accurate read classification. We compared it to conventional short- and long-read pipelines, using well-characterized mock bacterial samples. Our findings highlight the necessity of appropriate data-processing for taxonomic descriptions, expanding our understanding of the precise microbiome.
言語 en
書誌情報 en : Journal of Microbiological Methods

巻 221, p. 106929, 発行日 2024-06
出版者
出版者 Elsevier
言語 en
ISSN
収録物識別子タイプ PISSN
収録物識別子 0167-7012
書誌レコードID
収録物識別子タイプ EISSN
収録物識別子 1872-8359
DOI
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ DOI
関連識別子 10.1016/j.mimet.2024.106929
情報源
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ Local
関連識別子 23342004
言語 ja
関連名称 水産技術研究所　環境・応用部門　沿岸生態システム部 （横浜）
関連サイト
関連タイプ isIdenticalTo
識別子タイプ URI
関連識別子 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0167701224000411
言語 en
関連名称 Elsevier : Journal of Microbiological Methods
著者版フラグ
出版タイプ VoR
出版タイプResource http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
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Ver.1 2024-04-15 07:56:07.405722
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